享保６年，將軍吉宗下令設置了「意見箱」。藉由投遞至意見箱的投書，新的奉行所誕生了。又名「蟲奉行所」！為了保護人們免於遭受盤據江戶的大蟲所害，被選出的強者們大顯神通。
繼承父親的誌向來到江戶的菜鳥同心‧仁兵衛！然而他還不知道蟲奉行所令人驚訝的工作內容……
精力充沛就是仁兵衛的優點，盡管一直拖累大家，但似乎慢慢開始得到奉行所每個人的認同……
由於想要揭髮蟲奉行所秘密的下任將軍，以及操縱蟲的妖女的出現，使得蟲奉行所的周邊一下子熱鬧起來